Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelpQ01102 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms