Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin2bQ01097 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms