Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms