Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms