Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga4Q00651 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms