Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms