Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms