Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms