Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2cP97760 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2cP97760 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms