Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg1P97376 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms