Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1bP70700 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms