Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc9a3r1P70441 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms