Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms