Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shox2P70390 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shox2P70390 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms