Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms