Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms