Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pitx1P70314 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx1P70314 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms