Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sycp3P70281 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms