Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chl1P70232 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chl1P70232 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms