Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms