Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps4xP62702 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps4xP62702 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps4xP62702 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps4xP62702 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps4xP62702 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps4xP62702 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps4xP62702 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps4xP62702 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps4xP62702 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms