Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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