Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms