Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chp1P61022 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chp1P61022 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms