Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrnp1P59054 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp1P59054 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms