Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc3P59034 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc3P59034 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms