Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpa1P57784 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpa1P57784 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpa1P57784 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpa1P57784 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms