Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtnsP57757 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms