Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms