Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp25P57080 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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