Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TdgP56581 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TdgP56581 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TdgP56581 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TdgP56581 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TdgP56581 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms