Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AgrpP56473 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms