Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp5P56399 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms