Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtskP55097 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtskP55097 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtskP55097 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtskP55097 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms