Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad23aP54726 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms