Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CnbpP53996 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms