Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClgnP52194 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClgnP52194 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClgnP52194 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms