Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RoraP51448 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms