Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms