Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc13P50207 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms