Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb42P49222 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms