Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp3P49194 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms