Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CitP49025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CitP49025 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CitP49025 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CitP49025 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CitP49025 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CitP49025 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms