Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stt3aP46978 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms