Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms