Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms