Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms