Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TfamP40630 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TfamP40630 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TfamP40630 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TfamP40630 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms