Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd9P40240 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms