Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ThpoP40226 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms